El Hippocampus reidi es carnívoro y consumen pequeños crustáceos como los copépodos, anfípodos y camarones, así como larvas de peces y otros tipos de zooplancton. Los pocos estudios realizados sobre sus hábitos alimentarios sugieren que podrían tener una función importante en la reestructuración de, al menos, algunas comunidades de fauna bentónica. Los juveniles de Hippocampus suelen ser presa de atunes, bacalaos, noriegas, rayas, chernas de ley y cangrejos, así como de pingüinos y otras aves marinas. Los índices de depredación de Hippocampus adultos son bajos, probablemente porque es una especie altamente críptica (están aislados reproductivamente de otras especies) y posee un sólido armazón corporal.
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